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苗木的种植需要进行育苗，那么矮化苹果苗育苗时，选用的是生长快的砧木海棠果、西府海棠，比较抗寒、抗旱、耐涝、耐盐碱，与苹果嫁接亲合力强、根系发达、幼苗生长迅速，当年夏季就能达到嫁接的粗度。
矮化苹果苗的育苗要注意，把握适当的育苗时间以秋播为宜，播后随即覆膜，春播则要提早播种。
这样才能早出苗、早生长，延长前期生长日数，达到提早嫁接、当年成苗的目的。采取保护措施早春应做好防寒、保湿等措施。常见的保护措施有抗寒风障、阳畦、温床、地膜覆盖等。地膜加棚膜覆盖苗床集中育苗，然后移栽到露地嫁接圃。这种方法播种期能够提前，但必须等到晚霜过后才能移栽，否则嫁接圃还要采取保护措施。
为了解决这个矛盾，在生产上常采用双膜覆盖直播育苗的方式，但成本较高。提早摘心、提早嫁接当砧苗长到30厘米左右时即可摘心，促使其加粗生长；基径0.5－0.6厘米时可嫁接，并在6月底以前接完。只有这样，嫁接苗才有较长的生长时间。采取高位接芽措施高位接芽成活后不要立即剪贴，而是在接芽以上1－2厘米处将砧木折伤不折断，促使接芽萌发，待接芽长到5－6片真叶时再行剪砧。此外，提高嫁接部位，接芽下边留5－7片功能叶，以供给接芽所需要的养分，接芽成活后可以剪砧。
加强肥水管理选择肥沃地块作苗圃，并加大底肥的施入量。在定苗后到嫁接前，结合浇水每亩追肥尿素10－15公斤；嫁接成活后，每亩施尿素8－10公斤；8月上旬和9月上旬，每次每亩追施复合肥8－10公斤，叶面喷肥每15天1次，前期喷300倍液的尿素，后期喷300倍液的磷酸二氢钾。