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我们知道果树开花之后都需要进行授粉，矮化苹果苗不同于其他的大棚种植的水果类，蜜蜂授粉是不行的，需要有专门的授粉方式，那么矮化苹果苗是怎么进行授粉的呢？
1.授粉方式
矮化苹果苗上把相同品种的授粉叫自花授粉，把不品种之间的授粉叫异花授粉多数果树为异花授粉，只有少数为自花授粉。但无论哪种授粉方式，均以异花授粉对果树的开花结果与传种接代最为有利。因为异花授粉既能够提高果实的产量与质量，又能增强矮化苹果苗种子繁殖后代株体的生活力与适应性。
果树上常有单性花的雌雄异花、雌雄异株和两性花的自花不孕、雌雄蕊异熟、异长等现象，为了尽量减少自花授粉的发生，建造果园时， 一定要注意配置好授粉树。
2.授粉媒介
由于多数果树是异花授粉，所以授粉媒介对果树生产非常重要。矮化苹果苗上的授粉媒介主要是风和昆虫，依靠风传粉的花叫风媒花，依靠昆虫传粉的花叫虫媒花。传粉昆虫中以蜜蜂为主，其次是蝶类和蝇类。一般虫媒花为了适应招引昆虫， 其花冠比风媒花的花冠大而色艳，蜜腺发达且有香味。因此，果园保持通风透光和花期放蜂，有利于果树的相互传粉，提高坐果的数量与质量。
授粉好的矮化苹果苗，结的果子形状都是好的，像很多畸形的苹果都是因为授粉不合适造成的，因此授粉对于矮化苹果苗的种植有很重要的影响。